Formål

Formålet med biobanken og registeret er å foreta innsamling av biologisk materiale og data fra pasienter med sykdommer i lever og gallegang, med et fokus på sykdommen Primær Skleroserende Cholangitt. Det innsamlede materialet skal være en ressurs for forskere som ønsker å studere ulike aspekter ved sykdommer i lever og galleganger, for å øke forståelsen for sykdomsutviklingen og i neste instans bidra til bedre diagnose og behandling.

Organisering

Biobanken er initiert og driftet av Norsk senter for Primær Skleroserende Cholangitt (NoPSC). NoPSC er organisert som en enhet under Avdeling for Transplantasjonsmedisin i Klinikk for Kirurgi og Spesialisert Medisin ved Oslo universitetssykehus, Rikshospitalet.

Bakgrunn

Biobanken ble opprettet som en felles ressurs for forskningsprosjekter som er drevet eller støttet av NoPSC, men er selvsagt også til bruk for andre forskere som jobber med studier i forhold til sykdommer i lever og gallegang og godkjent av Regional Etisk Komite. Biobanken har per 2024 samlet inn mer en 155.000 prøverør fra over 2500 individer. Og det har blitt gjort nærmere 250 uttak av materiale og/eller data til ulike forsknings prosjekter. Det samles inn data og materiale til biobanken kontinuerlig, både ved inkludering av nye pasienter og i forbindelse med oppfølging av allerede inkluderte pasienter.

Kontakt

Formell leder for biobanken og registeret er Overlege Trine Folseraas, Seksjons for Gastromedisin, Avdeling for Transplantasjonsmedisin, Klinikk for Kirurgi og Spesialisert Medisin, Oslo Universitetssykehus
Epost: trine.folseraas@medisin.uio.no
Telefon: 23071892

Datalagring

Registeretinneholder informasjon innhentet direkte fra pasientene, i tillegg til journaldata og analysesvar. All informasjon i registeret og biobanken blir lagret i databasen Medinsight, som er godkjent for sikker lagring og som er tilgangsbegrenset. Alle prøver med biologisk materiale er kun merket med en barkode og scannet inn i den samme Medinsight databasen, slik at ethvert prøverør er fullstendig sporbart.

Studier som benytter informasjon fra registeret

Forskningsprosjekter som ønsker å bruke materiale fra biobanken må søke og studien må i hvert enkelt tilfelle være godkjent av Regional Etisk Komite (REK). Siden 2009 har det blitt tatt ut biologisk material og eller data ved nærmere 250 anledninger fra biobanken. Det aller meste til følgende prosjekter:

Tarmfloraens betydning for primær skleroserende cholangitt (REK nummer 30123)

• Studier av tarmfloraens sammensetning og funksjon ved PSC (ved bruk av avføringsprøver og slimhinnebiopsier)
• Studier av sirkulerende bakterieprodukter og relaterte stoffer i PSC, inkludert betydning for sykdomsprosessen og potensiell betydning som mål (biomarkør) på sykdomsaktivitet og sykdomsprogresjon

Basale og kliniske studier av levertransplantasjon og komplikasjoner etter levertransplantasjon (REK nummer 14908)

• Studier av forløp etter levertransplantasjon
• Studier av tarmfloraens sammensetning og funksjon ved PSC og tilbakefall av PSC etter transplantasjon
• Studier av sirkulerende bakterieprodukter og relaterte stoffer før og etter transplantasjon, inkludert betydning for sykdomsprosessen og potensiell betydning som biomarkører 

Genetisk studier i Primær Skleroserende Cholangitt (PSC) og small-duct PSC (REK nummer 28273)

• Studier av vanlige genvarianter i befolkningen og ved PSC og i hvilken grad disse påvirker sårbarhet for å få sykdommen

Funksjonell karakterisering av sykdomsgener i Primær Skleroserende Cholangitt (REK nummer 18221)

Antistoff i Primær Skleroserende Cholangitt (REK nummer 13381)

Tidlig diagnostisering i utviklingen av Cholangiocarcinom (REK nummer 28290)

The NoPSC Biobank is a modern digital biobank, where every sample is traceable throughout the system and where both clinical parameters and biological materials are registered.

The NoPSC Biobank was established in 2008 and during the years that followed a wide range of biological samples from patients with Primary Sclerosing Cholangitis (PSC) and other liver related liver diseases were collected. From 2013 we narrowed the collection to patients with PSC and cholangiocarcinoma, with a particular focus on the PSC prospective cohort study. In the prosepctive kohort, at Oslo University Hospital and Haukeland University Hospital in Bergen, we followed PSC patients with annual control and follow-up. From 2018 the yearly control and follow up became a part of the routine for these patients, but we still collect samples and clinical data annually. From 2016 we widened the collection again to also include samples and clinical data from patients with other autoimmune liver diseases.

Currently we focus the collection of blood samples for serum, DNA and RNA. In addition we collect bile, brushes and surplus tissue samples from various procedures (eg ERCP, liver transplantation). A team of medically educated scientific personnel from NoPSC collects tissue samples from relevant explanted livers when there is a liver transplant, facilitated by expert contributions from pathologists at the Department of Pathology.

All samples in the biobank are stored in tubes with a two-dimensional barcode and scanned into the MEDinsight database. In the database every individual tube is connected with information regarding sample date, preparation procedure, volume and position. Standard operation procedures (SOP's) are established for each material category, and are documented in the "Book of procedures for Biobanking at the Norwegian PSC Research Center" / "Procedurebok for NoPSC biobank" (see below).

After being positioned in the system, all samples are stored at either - 20 ° C, - 80 ° C or in liquid nitrogen. The MEDinsight database has an incorporated system for sample deposition, position and retrieval, and the samples are also connected to clinical information about the patient. Hence, retrieval from the biobank can be selected based on a wide range of clinical, technical and biological parameters.

As of 2024 we have collected more than 152000 samples of serum, plasma (EDTA / BDP), CTAD tubes, bile, bacterial DNA from feces, brushes from bile ducts, biopsies and urine. Of these over 15000 samples has been withdrawn and used for research purposes.

For more information about all standard operating procedures (SOPs), patient information and recruitment see "Procedure Book for NoPSC biobank" (in Norwegian), including. A shorter version in English is also available “Key sampling procedures from the NoPSC Biobank” (both below).

Use of the Biobank material 

Since 2009 different sets of materials from the NoPSC Biobank has been withdrawn close to 200 times. The majority of those withdrawals (almost 90) have been used by the Experimental Liver Research Group (Espen Melum) at NoPSC, in the study "Functional characterization of disease genes in primary sclerosing cholangitis". The rest of the withdrawals have been used by our other research groups: Genomics and Metagenomics in Inflammatory Disorders (Hov Group) and the Clincal Studies (Folseraas Group), under the following studies “Antibodies in primary sclerosing cholangitis”, “Genetic studies in primary sclerosing cholangitis ”and“ Early diagnostics in the development of cholangiocarcinoma ”. All studies are approved by the Regional Ethical board.