Sammendrag forskningsprosjekter
Det fundamentale skritt i progresjon av brystkreft er metastasering av tumor til andre deler av kroppen. Hovedtrinnene i denne prosessen er spredning av enkelt celler fra primærtumor til lymfeknuter, blod og benmarg (disseminerte tumor celler). Kunnskap om den molekylære signaturen av disseminerte tumor celler er ennå svært begrenset. Sammen med våre internasjonale samarbeidspartnerne har vi etablert avanserte teknikker for å analyse genomiske profiler av enkeltceller med høy oppløsning (mikromatrise teknikk). Målsetningen er å kartlegge DNA-profiler av disseminerte tumorceller fra benmarg og sammenholde disse funnene med isolerte tumorceller fra blod og DNA profilen av primærtumoren. Økt kunnskap og molekylær karakterisering av slike tumorceller vil kunne benyttes prognostisk og gi bedre diagnose og behandling. Prosjektet er tverrfaglig organisert og baserer seg på samarbeid mellom flere avdelinger ved Radiumhopsitalet, nasjonale og internasjonale forsknings grupper.
Sammendrag gene regulasjon i bryst kreft prosjekt
Et av kjennetegnene til humane kreft svulster er avvik i kopitall av gener. En metode som kalt mikromatrise Comparative Genomic Hybridization (array CGH) kan benyttes til å kartlegge med høy presisjon posisjonene til de gener som viser slikt avvik. Robuste analysemetoder for å kunne analysere forskjeller og likheten mellom alternative CGH teknikker har til nå vært mangelvare. Vi har utviklet en statistisk metode, basert på data samlet inn fra 20 bryst tumorer analysert, med forskjellige mikromatrise CGH metoder. I tillegg utnytter vi informasjon om genekspresjons, analysert med de samme typer mikromatriser som array CGH. Metode som vi har utviklet kalles Detection of Copy Number Abberations (DCNA). Verktøyet er laget for å sammenligne resultater og oppløsninger fra forskjellige mikromatrisemetoder. Vi vil nå benytte DCNA metoden til flere typer av mikromatriser. I vårt prosjekt bruker vi DCNA metode for å finne nye gener som er involvert i bryst kreft. Disse kandidatgener undersøker vi videre med hjelp av kvantitativt RT-PCR teknikken (real-time PCR), som fremstår som en av de mest etablerte og svært sensitivt metoder for å undersøke genekspresjon. Vi håper at resultater fra vår forskning i fremtiden kan utnyttes til å forbedre de diagnostiske og terapeutiske metoder innenfor kreftdiagnostikk og behandling.
Print this page [23 visits]
